UPCOMING WORKSHOPS

Sechsundzwanzigster Diversity Workbench Workshop am IT-Zentrum der SNSB, veranstaltet in Kooperation mit dem DFG-Verbundprojekt German Federation for Biological Data (GFBio)

Thema: Allgemeine Einführung in die DWB: Fokus Datenmanangement in Projekten zum Artenmonitoring sowie Management von Trait-Daten

An der Organisation und Durchführung des Workshops beteiligtes Team: D. Triebel, M. Weiss, D. Neubacher, W. Reichert, T. Weibulat, A. Link, V. Sanz und C. J. Monje, SMNS

Organisatorisches

Arbeitsprogramm

Thema ist das Management von verschiedenen Typen von primären Daten v. a. aus Monitoringprojekten, das Management von Merkmalsdaten zu Organismen, Trait-Daten, geographische Daten zu Beobachtungsereignissen und Sammlungsobjekten sowie Vokabularien/ Taxonomien in DWB-Applikationen. Die Teilnehmer werden angeleitet, mit den DWB-Applikationen in Trainingsdatenbanken selbständig zu arbeiten. Neben dem Arbeiten am Laptop/ PC wird auch die Dateneingabe über die Smartphone App "DiversityMobile" demonstriert.

Teilnehmer Institut Fachgebiet
Maria Elena Reiner-Drehwald Georg-August-Universität Göttingen Bryologie
Rafael Matysiuk Ludwig-Maximilian-Universität München Datenmanagement
Juan Carlos Monje Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Entomologie, Datenmanagement
Tanja Schweizer Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Entomologie
Annette Rosenbauer Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Botanik
Hossein Rajaei Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Entomologie
Jörg Spelda Zoologische Staatssammlung München Zoologie, Datenmanagement
Patrick Dornes Botanische Staatssammlung München Lichenologie
Petra Führding-Potschkat IBM München Datenbanken und Repositorien
Andreas Beck Botanische Staatssammlung München Lichenologie

Diversity Workbench Entwickler Plattform

Zugangsdaten zu den DWB Trainingsdatenbanken

Virtuelle Forschungsumgebungen und DWB Netzwerke, Diversity Mobile

Daten in DiversityCollection online

Daten in DiversityTaxonNames online

Daten in DiversityExsiccatae online

Diversity Workbench – DFG recommended

DFG RISources mit Diversity Workbench – Text DE

Literatur zum Workshop

Chapman, A. D. 2005. Principles and Methods of Data Cleaning – Primary Species and Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 72 pp. download

Chapman, A. D. 2005. Principles of Data Quality. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 58 pp. download

Chapman, A. D. 2005. Uses of Primary Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 106 pp. download

Chapman, A. D. & Grafton, O. 2008. Guide to Best Practices for Generalising Sensitive Species Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 21 pp. download

Chapman, A. D. & Wieczorek, J. 2006 (eds.). Biogeomancer, Guide to Best Practices in Georeferencing. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 80 pp. download

Frazier, C. K., Wall, J. & Grant, S. 2008. Initiating a Natural History Collection Digitisation Project, version 1.0. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 75 pp. download

Gray, J., Liu, D. T., Nieto-Santisteban, M., Szalay, A. S., DeWitt, D. & Heber, G. 2005. Scientific Data Management in the Coming Decade. – Technical Report MSR-TR-2005-10. – 8 pp. download

Hagedorn, G. 2008/2007. Structuring descriptive data of organisms – Requirement analysis and information models. – Dissertation, Universität Bayreuth. – 1–417. download

Jablonski, S., Kehl, A., Neubacher, D., Poschlod, P., Rambold, G., Schneider, T., Triebel, D., Volz, B. & Weiss, M. 2009. DiversityMobile – Mobile data retrieval platform for biodiversity research projects. – In Fischer, S., Maehle, E. & Reischuk, R. (eds.), Informatik 2009 – Im Focus das Leben. Beiträge der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e. V. (GI). GI-Edition: Lecture Notes in Informatics (LNI) - Proceedings 154: 27, 610–624. download

Rambold, G., Elix, J. A., Heindl-Tenhunen, B., Köhler, T., Nash III, T. H., Neubacher, D., Reichert, W., Zedda, L. & Triebel, D. 2014. LIAS light – Towards the ten thousand species milestone. – MycoKeys 8 : 11–16. doi: 10.3897/mycokeys.8.6605 download.

Tegelberg, R., Mononen, T. & Saarenmaa, H. 2014. High-performance digitization of natural history collections: Automated imaging lines for herbarium and insect specimens. – Taxon 63(6): 1307–1313. – http://dx.doi.org/10.12705/636.13

Tewksbury, J. et al. 2014. Natural History’s Place in Science and Society. - BioScience, biu032. download

Triebel, D. 2009. Pilzherbarien – Neue Aufgaben im Bereich Biodiversitätsinformatik und Datenmanagement. – In Anonymous (ed.), Rundgespräche der Kommission für Ökologie, herausgegeben von der Bayerischen Akademie der Wissenschaften, Band 37: Ökologische Rolle von Pilzen. – 131–145. München. download

Triebel, D., Hagedorn, G. & Rambold, G. 2012. An appraisal of megascience platforms for biodiversity information. – MycoKeys 5: 45–63. – doi:10.3897/mycokeys.5.4302 download

Triebel, D., Neubacher, D., Weiss, M., Heindl-Tenhunen, B., Nash. T. H. III & Rambold, G. 2010. Integrated biodiversity data networks for lichenology – data flows and challenges. – In Nash, T.H. III, Geiser, L., McCune, B., Triebel, D., Tomescu, A.M.F. & Sanders, W.B. (eds.), Biology of lichens – symbiosis, ecology, environmental monitoring, systematics and cyber applications. – Biblioth. Lichenol. 105: 47–56.

Triebel, D., Weibulat, T. & Bensch, K. 2014. Sammlungsschätze online – Schritte zur Virtuellen Naturhistorischen Sammlung. – Natur im Museum. – Mitteilungen der Fachgruppe Naturwissenschaftliche Museen im Deutschen Museumsbund 4: 31–35. download.

Walls, R. L. et al. 2014. Semantics in Support of Biodiversity Knowledge Discovery: An Introduction to the Biological Collections Ontology and Related Ontologies – PLOS ONE 9(3): 1–13. download

Wieczorek, J., Guo, Q. & Hijmans, R. J. 2004. The point-radius method for georeferencing locality descriptions and calculating associated uncertainty. Int. J. Geographical Information Science 18(8): 747–767 download

Papers "Towards a global strategy and action plant for discovery and publishing of natural history collections data" – 2010

Papers on a GBIF-supported "Data publishing framework for primary biodiversity data" – 2011

Papers on "Mass digitization of natural history collections" – 2012

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