UPCOMING WORKSHOPS

31. Diversity Workbench Workshop am IT-Zentrum der SNSB

Thema: Allgemeine Einführung in die Diversity Workbench Datenbank-Suite (=DWB); Schwerpunkt: Interoperabilität und Datenaustausch. (Die DWB-Datenbank "DiversityDescriptions" wird am 16. März 2017 am Staatlichen Museum für Naturkunde Stuttgart im 32. DWB Workshop vorgestellt.)

An der Organisation und Durchführung des Workshops beteiligtes Team: D. Triebel, A. Link, W. Reichert, T. Weibulat, M. Weiss

Organisatorisches

(um einen Unkostenbeitrag von € 15 wird gebeten)

Arbeitsprogramm

Thema ist das Management von Daten im Bereich Sammlungsverwaltung, Biodiversitätsforschung, Monitoringprojekten und Georeferenzierung. Dabei werden Fragen der Interoperabiliät und des Datenaustauschs behandelt und auf die Service-Typen in den GFBio Portfolios der Forschungsdatenzentren mit DWB-Installationen bezuggenommen. Die Teilnehmer werden angeleitet, mit den DWB-Applikationen in Trainingsdatenbanken selbständig zu arbeiten. Neben dem Arbeiten am Laptop wird auch die Dateneingabe über ein Smartphone mit der "DiversityMobile"-App demonstriert.

Teilnehmer Institut Fachgebiet
Tina Astor Georg-August-Universität Göttingen GFBio Outreach & Training
Alexander Bach RWTH Aachen University Zoologie
Bastian Brenzinger Zoologische Staatssammlung München Zoologie, Mollusca
Wolfgang Diewald Botanische Staatssammlung München und SNSB IT Center Flora von Bayern
Anneke van Heteren Zoologische Staatssammlung München Zoologie, Mammalia
Jonas Kirch RWTH Aachen University Zoologie
Klara Krämer RWTH Aachen University Zoologie
Daniela Kugelmann Ludwig-Maximilians-Universität München, Anatomische Anstalt Medizin
Gertrud Rößner Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie Fossile Säugetiere
Marco Schmidt Senckenberg Biodiversity and Climate Research Centre Botanik, Data & Modelling
Peter Schuchert Muséum d'histoire naturelle, Genève Zoologie
Axel Unverzagt Ludwig-Maximilians-Universität München, Anatomische Anstalt Medizin

Diversity Workbench Entwickler Plattform

Zugangsdaten zu den DWB Trainingsdatenbanken

Diversity Workbench – empfohlen von DFG und GFBio

DFG RISources mit Diversity Workbench – Text DE

GFBio recommended research data management und GFBio guided research data submission mit Diversity Workbench

Dienste des SNSB IT Center in seiner Rolle als GFBio Datenzentrum

GBOL Data Transfer Applications

Virtuelle Forschungsumgebungen und DWB Netzwerke, Diversity Mobile

Daten in DiversityCollection online

Daten in DiversityTaxonNames online

Daten in DiversityExsiccatae online

Literatur zum Workshop

Chapman, A. D. 2005. Principles and Methods of Data Cleaning – Primary Species and Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 72 pp. download

Chapman, A. D. 2005. Principles of Data Quality. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 58 pp. download

Chapman, A. D. 2005. Uses of Primary Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 106 pp. download

Chapman, A. D. & Grafton, O. 2008. Guide to Best Practices for Generalising Sensitive Species Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 21 pp. download

Chapman, A. D. & Wieczorek, J. 2006 (eds.). Biogeomancer, Guide to Best Practices in Georeferencing. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 80 pp. download

Frazier, C. K., Wall, J. & Grant, S. 2008. Initiating a Natural History Collection Digitisation Project, version 1.0. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 75 pp. download

Gray, J., Liu, D. T., Nieto-Santisteban, M., Szalay, A. S., DeWitt, D. & Heber, G. 2005. Scientific Data Management in the Coming Decade. – Technical Report MSR-TR-2005-10. – 8 pp. download

Hagedorn, G. 2008/2007. Structuring descriptive data of organisms – Requirement analysis and information models. – Dissertation, Universität Bayreuth. – 1–417. download

Jablonski, S., Kehl, A., Neubacher, D., Poschlod, P., Rambold, G., Schneider, T., Triebel, D., Volz, B. & Weiss, M. 2009. DiversityMobile – Mobile data retrieval platform for biodiversity research projects. – In Fischer, S., Maehle, E. & Reischuk, R. (eds.), Informatik 2009 – Im Focus das Leben. Beiträge der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e. V. (GI). GI-Edition: Lecture Notes in Informatics (LNI) - Proceedings 154: 27, 610–624. download

Rambold, G., Elix, J. A., Heindl-Tenhunen, B., Köhler, T., Nash III, T. H., Neubacher, D., Reichert, W., Zedda, L. & Triebel, D. 2014. LIAS light – Towards the ten thousand species milestone. – MycoKeys 8 : 11–16. doi: 10.3897/mycokeys.8.6605 download.

Rambold, G., Zedda, L., Coyle, J., Peršoh, D., Köhler, T., Triebel, D. (2016). Geographic heat maps of lichen traits derived by combining LIAS light description and GBIF occurrence data, provided on a new platform. – Biodiversity and Conservation 25(13): 2743–2751. (doi:10.1007/s10531-016-1199-2).

Tegelberg, R., Mononen, T. & Saarenmaa, H. 2014. High-performance digitization of natural history collections: Automated imaging lines for herbarium and insect specimens. – Taxon 63(6): 1307–1313. – http://dx.doi.org/10.12705/636.13

Tewksbury, J. et al. 2014. Natural History’s Place in Science and Society. - BioScience, biu032. download

Triebel, D. 2009. Pilzherbarien – Neue Aufgaben im Bereich Biodiversitätsinformatik und Datenmanagement. – In Anonymous (ed.), Rundgespräche der Kommission für Ökologie, herausgegeben von der Bayerischen Akademie der Wissenschaften, Band 37: Ökologische Rolle von Pilzen. – 131–145. München. download

Triebel, D., Hagedorn, G. & Rambold, G. 2012. An appraisal of megascience platforms for biodiversity information. – MycoKeys 5: 45–63. – doi:10.3897/mycokeys.5.4302 download

Triebel, D., Neubacher, D., Weiss, M., Heindl-Tenhunen, B., Nash. T. H. III & Rambold, G. 2010. Integrated biodiversity data networks for lichenology – data flows and challenges. – In Nash, T.H. III, Geiser, L., McCune, B., Triebel, D., Tomescu, A.M.F. & Sanders, W.B. (eds.), Biology of lichens – symbiosis, ecology, environmental monitoring, systematics and cyber applications. – Biblioth. Lichenol. 105: 47–56.

Triebel, D., Weibulat, T. & Bensch, K. 2014. Sammlungsschätze online – Schritte zur Virtuellen Naturhistorischen Sammlung. – Natur im Museum. – Mitteilungen der Fachgruppe Naturwissenschaftliche Museen im Deutschen Museumsbund 4: 31–35. download.

Walls, R. L. et al. 2014. Semantics in Support of Biodiversity Knowledge Discovery: An Introduction to the Biological Collections Ontology and Related Ontologies – PLOS ONE 9(3): 1–13. download

Wieczorek, J., Guo, Q. & Hijmans, R. J. 2004. The point-radius method for georeferencing locality descriptions and calculating associated uncertainty. Int. J. Geographical Information Science 18(8): 747–767 download

Papers "Towards a global strategy and action plant for discovery and publishing of natural history collections data" – 2010

Papers on a GBIF-supported "Data publishing framework for primary biodiversity data" – 2011

Papers on "Mass digitization of natural history collections" – 2012

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