UPCOMING WORKSHOPS

33. Diversity Workbench Workshop am IT-Zentrum der SNSB

Thema: Allgemeine Einführung in die Diversity Workbench Datenbank-Suite (=DWB); Schwerpunkt: Nachhaltiges Datenmanagement, Archivierung und Datenpublikation mit Bezug zu German Federation for Biological Data (GFBio) und GBIF.

An der Organisation und Durchführung des Workshops beteiligtes Team: D. Triebel, A. Link, W. Reichert, T. Weibulat, M. Weiss

Anmerkung: Die DWB-Datenbank "DiversityDescriptions" wird in einem separaten von GFBio veranstalteten Workshop voraussichtlich im November 2017 vorgestellt.

Organisatorisches

(um einen Unkostenbeitrag von € 15 wird gebeten)

Arbeitsprogramm

Thema ist das Management von Daten im Bereich Sammlungsverwaltung, Biodiversitätsforschung, Monitoringprojekten und Georeferenzierung. Dabei werden Fragen der Interoperabiliät und des Datenaustauschs behandelt und auf die Service-Typen in den GFBio Portfolios der Forschungsdatenzentren mit DWB-Installationen bezuggenommen. Die Teilnehmer werden angeleitet, mit den DWB-Applikationen in Trainingsdatenbanken selbständig zu arbeiten. Neben dem Arbeiten am Laptop wird auch die Dateneingabe über ein Smartphone mit der "DiversityMobile"-App demonstriert.

Teilnehmer Institut Fachgebiet
Christiane Dalitz Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Botanik (Sammlungsmanagement)
Diane Falkenberg Botanische Staatssammlung München Bryologie, Lichenologie, Mykologie, Phykologie (Sammlungsmanagement)
Danilo Harms Centrum für Naturkunde, Universität Hamburg Zoologie (Arachnologie)
Christoph Heibl Nationalpark Bayerischer Wald, Grafenau Botanik
Angela Jandl Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Datenbank-Administratorin DWB
Milan Pallmann Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Zoologie (Entomologie; Sammlungsmanagement)
Anette Rosenbauer Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Botanik (Sammlungsmanagement)
Tanja Schweizer Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Zoologie (Entomologie; Sammlungsmanagement)

Diversity Workbench Entwickler Plattform

Zugangsdaten zu den DWB Trainingsdatenbanken

Diversity Workbench – empfohlen von DFG und GFBio

DFG RISources mit Diversity Workbench – Text DE

GFBio recommended research data management und GFBio guided research data submission mit Diversity Workbench

Dienste des SNSB IT Center in seiner Rolle als GFBio Datenzentrum

GBOL Data Transfer Applications

Virtuelle Forschungsumgebungen und DWB Netzwerke, Diversity Mobile

Daten in DiversityCollection online

Daten in DiversityTaxonNames online

Daten in DiversityExsiccatae online

Literatur zum Workshop

Chapman, A. D. 2005. Principles and Methods of Data Cleaning – Primary Species and Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 72 pp. download

Chapman, A. D. 2005. Principles of Data Quality. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 58 pp. download

Chapman, A. D. 2005. Uses of Primary Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 106 pp. download

Chapman, A. D. & Grafton, O. 2008. Guide to Best Practices for Generalising Sensitive Species Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 21 pp. download

Chapman, A. D. & Wieczorek, J. 2006 (eds.). Biogeomancer, Guide to Best Practices in Georeferencing. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 80 pp. download

Frazier, C. K., Wall, J. & Grant, S. 2008. Initiating a Natural History Collection Digitisation Project, version 1.0. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 75 pp. download

Gray, J., Liu, D. T., Nieto-Santisteban, M., Szalay, A. S., DeWitt, D. & Heber, G. 2005. Scientific Data Management in the Coming Decade. – Technical Report MSR-TR-2005-10. – 8 pp. download

Hagedorn, G. 2008/2007. Structuring descriptive data of organisms – Requirement analysis and information models. – Dissertation, Universität Bayreuth. – 1–417. download

Jablonski, S., Kehl, A., Neubacher, D., Poschlod, P., Rambold, G., Schneider, T., Triebel, D., Volz, B. & Weiss, M. 2009. DiversityMobile – Mobile data retrieval platform for biodiversity research projects. – In Fischer, S., Maehle, E. & Reischuk, R. (eds.), Informatik 2009 – Im Focus das Leben. Beiträge der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e. V. (GI). GI-Edition: Lecture Notes in Informatics (LNI) - Proceedings 154: 27, 610–624. download

Rambold, G., Elix, J. A., Heindl-Tenhunen, B., Köhler, T., Nash III, T. H., Neubacher, D., Reichert, W., Zedda, L. & Triebel, D. 2014. LIAS light – Towards the ten thousand species milestone. – MycoKeys 8 : 11–16. doi: 10.3897/mycokeys.8.6605 download.

Rambold, G., Zedda, L., Coyle, J., Peršoh, D., Köhler, T., Triebel, D. (2016). Geographic heat maps of lichen traits derived by combining LIAS light description and GBIF occurrence data, provided on a new platform. – Biodiversity and Conservation 25(13): 2743–2751. (doi:10.1007/s10531-016-1199-2).

Tegelberg, R., Mononen, T. & Saarenmaa, H. 2014. High-performance digitization of natural history collections: Automated imaging lines for herbarium and insect specimens. – Taxon 63(6): 1307–1313. – http://dx.doi.org/10.12705/636.13

Tewksbury, J. et al. 2014. Natural History’s Place in Science and Society. - BioScience, biu032. download

Triebel, D. 2009. Pilzherbarien – Neue Aufgaben im Bereich Biodiversitätsinformatik und Datenmanagement. – In Anonymous (ed.), Rundgespräche der Kommission für Ökologie, herausgegeben von der Bayerischen Akademie der Wissenschaften, Band 37: Ökologische Rolle von Pilzen. – 131–145. München. download

Triebel, D., Hagedorn, G. & Rambold, G. 2012. An appraisal of megascience platforms for biodiversity information. – MycoKeys 5: 45–63. – doi:10.3897/mycokeys.5.4302 download

Triebel, D., Neubacher, D., Weiss, M., Heindl-Tenhunen, B., Nash. T. H. III & Rambold, G. 2010. Integrated biodiversity data networks for lichenology – data flows and challenges. – In Nash, T.H. III, Geiser, L., McCune, B., Triebel, D., Tomescu, A.M.F. & Sanders, W.B. (eds.), Biology of lichens – symbiosis, ecology, environmental monitoring, systematics and cyber applications. – Biblioth. Lichenol. 105: 47–56.

Triebel, D., Weibulat, T. & Bensch, K. 2014. Sammlungsschätze online – Schritte zur Virtuellen Naturhistorischen Sammlung. – Natur im Museum. – Mitteilungen der Fachgruppe Naturwissenschaftliche Museen im Deutschen Museumsbund 4: 31–35. download.

Walls, R. L. et al. 2014. Semantics in Support of Biodiversity Knowledge Discovery: An Introduction to the Biological Collections Ontology and Related Ontologies – PLOS ONE 9(3): 1–13. download

Wieczorek, J., Guo, Q. & Hijmans, R. J. 2004. The point-radius method for georeferencing locality descriptions and calculating associated uncertainty. Int. J. Geographical Information Science 18(8): 747–767 download

Papers "Towards a global strategy and action plant for discovery and publishing of natural history collections data" – 2010

Papers on a GBIF-supported "Data publishing framework for primary biodiversity data" – 2011

Papers on "Mass digitization of natural history collections" – 2012

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