UPCOMING WORKSHOPS

Dreißigster Diversity Workbench Workshop am IT-Zentrum der SNSB

Thema: Allgemeine Einführung in die DWB, besonderer Schwerpunkt: Datenmanagement in Barcoding-Projekten. (Zur Einführung in DiversityDescriptions wird ein eigener Workshop vorbereitet).

An der Organisation und Durchführung des Workshops beteiligtes Team: D. Triebel, K. Bensch, A. Link, W. Reichert, T. Weibulat, M. Weiss

Organisatorisches

Arbeitsprogramm

Thema ist das Management von Daten im Bereich Sammlungsverwaltung, Biodiversitätsforschung und Georeferenzierung. Die verschiedenen Typen von Interaktionen der in diesem Kontext zentralen Komponente DiversityCollection (=DC) mit anderen Komponenten der Diversity Workbench (=DWB) werden vorgeführt. Die Teilnehmer werden angeleitet, mit den DWB-Applikationen in Trainingsdatenbanken selbständig zu arbeiten. Neben dem Arbeiten am Laptop wird auch die Dateneingabe über ein Smartphone mit der "DiversityMobile"-App demonstriert.

Teilnehmer Institut Fachgebiet
Thomas Burri Naturhistorisches Museum der Burgergemeinde Bern Erdwissenschaften
Ulrike Damm Senckenberg Museum für Naturkunde Görlitz Mykologie
Ursula Eberhardt Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Mykologie
Andreas Gröger Botanischer Garten München-Nymphenburg Botanik
Janno Harjes Universität Bayreuth Mykologie
Gisa Heinemann Georg-August-Universität Göttingen Zoologie
Simone Heitkämper Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung Braunschweig Mykologie
Stefan Hertwig Naturhistorisches Museum der Burgergemeinde Bern Zoologie (Wirbeltiere)
Martin Kemler Universität Bochum Mykologie
Cornelia Krause Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Mykologie
Sigrid Liede-Schumann Universität Bayreuth Botanik
Eike Neubert Naturhistorisches Museum der Burgergemeinde Bern Zoologie (Wirbellose)
Martin Nickol Botanischer Garten der Christian-Albrechts-Universität zu Kiel Botanik
Flavius Popa Nationalpark Schwarzwald Mykologie und Bodenökologie
Michaela Schwager Senckenberg Museum für Naturkunde Görlitz Mykologie
Janine Schyra Senckenberg Naturhistorische Sammlungen Dresden Zoologie
Chris Sherry Naturhistorisches Museum der Burgergemeinde Bern Informatik
Cäcilia Spitzweg Senckenberg Naturhistorische Sammlungen Dresden Zoologie
Andreas Weck-Heimann Senckenberg Naturhistorische Sammlungen Dresden Zoologie
Carsten Wortmann Georg-August-Universität Göttingen Zoologie

Diversity Workbench Entwickler Plattform

Zugangsdaten zu den DWB Trainingsdatenbanken

GBOL Data Transfer Applications

Virtuelle Forschungsumgebungen und DWB Netzwerke, Diversity Mobile

Daten in DiversityCollection online

Daten in DiversityTaxonNames online

Daten in DiversityExsiccatae online

Diversity Workbench – DFG and GFBio recommended

DFG RISources mit Diversity Workbench – Text DE

GFBio recommended research data management and GFBio guided research data submission with Diversity Workbench

Services of the SNSB IT Center in its role as GFBio data center

Literatur zum Workshop

Chapman, A. D. 2005. Principles and Methods of Data Cleaning – Primary Species and Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 72 pp. download

Chapman, A. D. 2005. Principles of Data Quality. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 58 pp. download

Chapman, A. D. 2005. Uses of Primary Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 106 pp. download

Chapman, A. D. & Grafton, O. 2008. Guide to Best Practices for Generalising Sensitive Species Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 21 pp. download

Chapman, A. D. & Wieczorek, J. 2006 (eds.). Biogeomancer, Guide to Best Practices in Georeferencing. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 80 pp. download

Frazier, C. K., Wall, J. & Grant, S. 2008. Initiating a Natural History Collection Digitisation Project, version 1.0. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 75 pp. download

Gray, J., Liu, D. T., Nieto-Santisteban, M., Szalay, A. S., DeWitt, D. & Heber, G. 2005. Scientific Data Management in the Coming Decade. – Technical Report MSR-TR-2005-10. – 8 pp. download

Hagedorn, G. 2008/2007. Structuring descriptive data of organisms – Requirement analysis and information models. – Dissertation, Universität Bayreuth. – 1–417. download

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Rambold, G., Elix, J. A., Heindl-Tenhunen, B., Köhler, T., Nash III, T. H., Neubacher, D., Reichert, W., Zedda, L. & Triebel, D. 2014. LIAS light – Towards the ten thousand species milestone. – MycoKeys 8 : 11–16. doi: 10.3897/mycokeys.8.6605 download.

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Triebel, D. 2009. Pilzherbarien – Neue Aufgaben im Bereich Biodiversitätsinformatik und Datenmanagement. – In Anonymous (ed.), Rundgespräche der Kommission für Ökologie, herausgegeben von der Bayerischen Akademie der Wissenschaften, Band 37: Ökologische Rolle von Pilzen. – 131–145. München. download

Triebel, D., Hagedorn, G. & Rambold, G. 2012. An appraisal of megascience platforms for biodiversity information. – MycoKeys 5: 45–63. – doi:10.3897/mycokeys.5.4302 download

Triebel, D., Neubacher, D., Weiss, M., Heindl-Tenhunen, B., Nash. T. H. III & Rambold, G. 2010. Integrated biodiversity data networks for lichenology – data flows and challenges. – In Nash, T.H. III, Geiser, L., McCune, B., Triebel, D., Tomescu, A.M.F. & Sanders, W.B. (eds.), Biology of lichens – symbiosis, ecology, environmental monitoring, systematics and cyber applications. – Biblioth. Lichenol. 105: 47–56.

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Walls, R. L. et al. 2014. Semantics in Support of Biodiversity Knowledge Discovery: An Introduction to the Biological Collections Ontology and Related Ontologies – PLOS ONE 9(3): 1–13. download

Wieczorek, J., Guo, Q. & Hijmans, R. J. 2004. The point-radius method for georeferencing locality descriptions and calculating associated uncertainty. Int. J. Geographical Information Science 18(8): 747–767 download

Papers "Towards a global strategy and action plant for discovery and publishing of natural history collections data" – 2010

Papers on a GBIF-supported "Data publishing framework for primary biodiversity data" – 2011

Papers on "Mass digitization of natural history collections" – 2012

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