__ → [UPCOMING WORKSHOPS|http://www.snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/Wiki.jsp?page=UpcomingWorkshops]__ !! Neunzehnter DiversityWorkbench Workshop am [IT Zentrum der SNSB|http://www.snsb.info] – in Kooperation mit [German Barcode of Life|https://www.bolgermany.de/] __Schwerpunkt: Datenmanagement im Rahmen von Monitoring- und Barcoding-Projekten__ Ansprechpartner von GBOL, ZFMK Bonn: [S. Pietsch|mailto:s.pietsch@zfmk.de] [P. Grobe|mailto:p.grobe@zfmk.de], [B. Rulik|mailto:B.Rulik@zfmk.de] Team am SNSB IT-Zentrum: [D. Triebel|mailto:triebel@bsm.mwn.de], [M. Weiss|mailto:weiss@bsm.mwn.de], [D. Neubacher|mailto:neubacher@bsm.mwn.de], [W. Reichert|mailto:reichert@bsm.mwn.de], [T. Weibulat|mailto:weibulat@bsm.mwn.de], [M. Knick|mailto:knick@bsm.mwn.de], [A. Link|mailto:weibulat@bsm.mwn.de] ! Organisatorisches *Ansprechpartner (Anreise etc.): [I. Sebek|mailto:office@bsm.mwn.de], [T. Weibulat|mailto:weibulat@bsm.mwn.de] *Ort: [Botanische Staatssammlung München|http://www.botanischestaatssammlung.de], Menzinger Str. 67, 1. Stock, Zimmer 139 *Anreise **vom Flughafen München (Gesamtdauer ca. 60 min): Von der S-Bahn-Endhaltestelle am Flughafen mit der S-Bahn (S 1) Richtung Hauptbahnhof. Die S-Bahn fährt alle 20 min. Aussteigen an der Haltestelle Moosach. Die Haltestellen zeigt die [Übersicht des Schnellbahnnetzes |http://www.mvv-muenchen.de/fileadmin/media/Dateien/4_Service/dokumente/downloadbereich/schnellbahn-netzplan2011.pdf]. Ab Bahnhof Moosach mit der Buslinie 51 Richtung Aidenbachstraße. Der Bus fährt alle 10 min. Haltestelle ist Maria-Ward-Straße. Von hier aus sind es 400 m zu Fuß entlang der Menzingerstraße stadtauswärts, wahlweise kann auch noch die Tramlinie 17 (Richtung Amalienburgstraße) für eine Haltestelle benutzt werden. Details zeigt das [Innenraumnetz München|http://www.mvv-muenchen.de/fileadmin/media/Dateien/plaene/pdf/innenraum_Metrobus_27.04.2012.pdf] und die [MVV Fahrplanauskunft|http://www.mvv-muenchen.de/de/startseite/index.html]. **vom Hauptbahnhof München (Gesamtdauer ca. 20 min): Ab Hauptbahnhof Nord mit der Trambahnlinie 17 Richtung Amalienburgstraße. Die Tram fährt alle 10 min. Haltestelle ist der Botanische Garten München-Nymphenburg. Details zeigt das [Innenraumnetz München|http://www.mvv-muenchen.de/fileadmin/media/Dateien/plaene/pdf/innenraum_Metrobus_27.04.2012.pdf] und die [MVV Fahrplanauskunft|http://www.mvv-muenchen.de/de/startseite/index.html]. * Zeit: 12.08.2013, Beginn: 10.00 Uhr, Ende: ca. 17.00 Uhr * Mittagspause: ca. 12.30 Uhr bis 13.30 Uhr * Kaffeepause: ca. 14.45 Uhr bis 15.00 Uhr * Hardware: eigener Laptop (ab MS Windows XP; .Net Framework 3.5 wird ggf. vor Ort installiert) ! Arbeitsprogramm Thema ist das Management von wissenschaftlichen Daten im Rahmen von Monitoring- und Barcoding-Projekten: Sammlungs- und Beobachtungsdaten, Taxonreferenzlisten und Georeferenzierung; Datenmobilisierung, Datenimporte. Die in diesem Kontext zentralen Komponenten sind DiversityCollection (=DC) und DiversityTaxonNames. Zur Verwaltung von strukturierten Artbeschreibungen wird DiversityDescriptions eingesetzt. Die Teilnehmer werden angeleitet, mit den DWB-Applikationen in Trainingsdatenbanken selbständig zu arbeiten. Neben dem Arbeiten am Desktop wird auch die Dateneingabe über die Smartphone App "DiversityMobile" demonstriert. * 10.00 Uhr [Diversity Workbench – Systemdesign, Datenflüsse und Datenbank-Infrastruktur für Projekte der DFG und des BMBF|Attachments/Triebel-DWBWorkshop19.pdf] (D. Triebel) * 10.15 Uhr Einführung in "DiversityCollection" mit DC-Import-Wizard anhand des DC-Manuals ([pdf|http://diversityworkbench.net/w/media/4/4e/DiversityCollection_Manual_2013-07.pdf]); Arbeiten mit DWB-Trainingsdatenbanken (M. Weiss) * 11.30 Uhr [DiversityDescriptions: DD 2.0 – DD 3.0|Attachments/Triebel-Link_DD-DWBWorkshop19.pdf] mit Software-Demonstration DD 3.0 (D. Triebel, A. Link) * 12.00 Uhr Kurze Vorstellung der [Möglichkeiten mobiler Datenerfassung|Attachments/Weibulat_DiversityMobile_DWB-Workshop19.pdf] mit der DWB, mit Schwerpunkt auf "DiversityMobile"(T. Weibulat) * 12.30 Uhr Mittagspause mit Kurzdemo im Botanischen Garten: "DiversityMobile" auf Smartphone (W. Ahlmer, T. Weibulat) * 13.30 Uhr Einführung in "DiversityTaxonNames" anhand des DTN-Manuals ([pdf|http://diversityworkbench.net/w/media/d/da/DiversityTaxonNames_Manual_2013-07.pdf]), Erstellung und Pflege von Taxonreferenzlisten; Arbeiten mit DWB-Trainingsdatenbanken (M. Weiss) * 14.30 Uhr German Barcode of Life (GBOL): [GBOL Taxon-Referenzlisten für Deutschland|http://www.diversitymobile.net/wiki/GBOL_Taxon-Referenzlisten_f%C3%BCr_Deutschland] (B. Rulik, P. Grobe, D. Triebel) * 14.45 Uhr Kaffeepause * 15.00 Uhr [German Barcode of Life (GBOL): DiversityCollection zum Management von GBOL-DNA-Proben|Attachments/Weibulat_GBOL%2BDWB_DWB-Workshop19.pdf] (P. Grobe, T. Weibulat) * 15.30 Uhr Arbeiten mit DWB-Trainingsdatenbanken (M. Weiss) * 16.15 Uhr Vorstellung von "DiversityGISeditor", "DiversitySamplingPlots" und "DiversityGazetteer" (W. Reichert) * 17.00 Uhr Ende P. S.: "DiversityAgents", "DiversityProjects", "DiversityReferences" und "DiversityScientificTerms" sind nicht Thema dieses 19. DWB Workshops. || Teilnehmer || Institut || Fachgebiet | Sandra Franz | LMU München | Ökologie | Wolfgang Ahlmer | Botanische Staatssammlung München | Botanik | Karl-Heinz Rexer | Philipps-Universität Marburg | Mykologie | Stefanie Rudolph | Universität Frankfurt am Main | Mykologie | Hubert Höfer | Staatliches Museum für Naturkunde Karlsruhe | Arthropoda | Florian Raub | Staatliches Museum für Naturkunde Karlsruhe | Arthropoda | Veronica Sanz | Botanische Staatssammlung München | Mykologie | Konstanze Bensch | Botanische Staatssammlung München | Mykologie | Jürgen Klotz | Universität Regensburg | Botanik ! Diversity Workbench Entwickler Plattform * [Diversity Workbench Information Models|http://www.diversityworkbench.net/Portal/Information_models] * [Diversity Workbench Software|http://www.diversityworkbench.net/Portal/Software] !Zugangsdaten zur DWB Trainingsdatenbank *IP-Adresse: training.diversityworkbench.de *Port: 5432 *SQL-Server authentification **User: Training **Password: available on request *Restrict to DiversityCollection... ! Virtuelle Forschungsumgebung und Diversity Mobile * [Workflow IBF|http://www.diversitymobile.net/wiki/IBF_Project] * [DiversityMobile|http://www.diversitymobile.net/wiki/DiversityMobile_WP] on Smartphones with WindowsPhone ! Daten in DiversityCollection online * via GBIF Portal [SNSB GBIF Data Publisher|http://data.gbif.org/datasets/provider/158] * 33 [BioCase-Wrapper Dienste|http://www.snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/Wiki.jsp?page=BioCASeWrapperSNSB] am SNSB IT-Zentrum * 10 Webschnittstellen mit Zugriff auf Daten via DiversityCollectionCache |__[Botanische Staatssammlung München|http://www.botanischestaatssammlung.de]__ |[The Erysiphales Collection|http://www.botanischestaatssammlung.de/DatabaseClients/BSMeryscoll/] |[The Lichenicolous Fungi Collection|http://www.botanischestaatssammlung.de/DatabaseClients/BSMlichfungicoll/] |[The Myxomycetes Collections|http://www.botanischestaatssammlung.de/DatabaseClients/BSMmyxcoll/] |[Water Colours of Fungi by Fritz Wohlfarth|http://www.botanischestaatssammlung.de/DatabaseClients/BSMwohlfcoll/] |[Water Colours of Fungi by Konrad Schieferdecker|http://www.botanischestaatssammlung.de/DatabaseClients/BSMschiefcoll/] |__[GBIF-D Mycology|http://www.gbif-mycology.de]__ |[The Fungal Collection at GLM|http://www.gbif-mycology.de/DatabaseClients/GLMcoll/] |[Epiphytic Lichens of G. Lettau at B|http://www.gbif-mycology.de/DatabaseClients/Blettaucoll/] |[The Erysiphales Collection at HAL|http://www.gbif-mycology.de/DatabaseClients/HALcoll/] |__[BIOTA Africa|http://www.biota-africa.org]__ |[BIOTA Southern Africa – The Collection of Lichens|http://www.botanischestaatssammlung.de/DatabaseClients/BIOTAlichencoll/] |__[SNSB IT Center|http://www.snsb.info]__ |[The Mammalia Collection at SAPM|http://www.snsb.info/DatabaseClients/SAPMmammaliacoll/] ! Daten in DiversityTaxonNames online * via [Catalogue of Life/ Annual/Dynamic Checklist Portal|http://www.catalogueoflife.org/]: Source databases "GSDs" [LIAS|http://www.catalogueoflife.org/col/details/database/id/79] und [MELnet|http://www.catalogueoflife.org/col/details/database/id/102] * 2 Webschnittstellen und SOAP webservices mit Zugriff auf DTN Datenbanken: ** [LIAS names|http://liasnames.lias.net/] ** [Melastomataceae.Net|http://www.melastomataceae.net/MELnames/] ! Literatur zum Workshop Chapman, A. D. 2005. Principles and Methods of Data Cleaning – Primary Species and Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 72 pp. [download|http://www.gbif.org/orc/?doc_id=1262&l=en] Chapman, A. D. 2005. Principles of Data Quality. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 58 pp. [download|http://www.gbif.org/orc/?doc_id=1229&l=en] Chapman, A. D. 2005. Uses of Primary Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 106 pp. [download|http://www.gbif.org/orc/?doc_id=1300&l=en] Chapman, A. D. & Grafton, O. 2008. Guide to Best Practices for Generalising Sensitive Species Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 21 pp. [download|http://www.gbif.org/orc/?doc_id=1233] Chapman, A. D. & Wieczorek, J. 2006 (eds.). Biogeomancer, Guide to Best Practices in Georeferencing. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 80 pp. [download|http://www.gbif.org/orc/?doc_id=1288&l=en] Frazier, C. K., Wall, J. & Grant, S. 2008. Initiating a Natural History Collection Digitisation Project, version 1.0. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 75 pp. [download|http://www.gbif.org/orc/?doc_id=2176] Gray, J., Liu, D. T., Nieto-Santisteban, M., Szalay, A. S., DeWitt, D. & Heber, G. 2005. Scientific Data Management in the Coming Decade. – Technical Report MSR-TR-2005-10. – 8 pp. [download|http://arxiv.org/ftp/cs/papers/0502/0502008.pdf] Jablonski, S., Kehl, A., Neubacher, D., Poschlod, P., Rambold, G., Schneider, T., Triebel, D., Volz, B. & Weiss, M. 2009. DiversityMobile – Mobile data retrieval platform for biodiversity research projects. – In Fischer, S., Maehle, E. & Reischuk, R. (eds.), Informatik 2009 – Im Focus das Leben. Beiträge der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e. V. (GI). GI-Edition: Lecture Notes in Informatics (LNI) - Proceedings 154: 27, 610–624. [download|http://www.diversitymobile.net/wiki/images/3/30/GI2009_jablonski_et-al.pdf] Triebel, D. 2009. Pilzherbarien – Neue Aufgaben im Bereich Biodiversitätsinformatik und Datenmanagement. – In Anonymous (ed.), Rundgespräche der Kommission für Ökologie, herausgegeben von der Bayerischen Akademie der Wissenschaften, Band 37: Ökologische Rolle von Pilzen. – 131–145. München. [download|http://www.diversitymobile.net/wiki/media/Triebel_2009.pdf] __New!__ Triebel, D., Hagedorn, G. & Rambold, G. 2012. An appraisal of megascience platforms for biodiversity information. – MycoKeys 5: 45–63. – [doi:10.3897/mycokeys.5.4302|http://www.pensoft.net/journals/mycokeys/article/4302/] Triebel, D., Neubacher, D., Weiss, M., Heindl-Tenhunen, B., Nash. T. H. III & Rambold, G. 2010. Integrated biodiversity data networks for lichenology – data flows and challenges. – In Nash, T.H. III, Geiser, L., McCune, B., Triebel, D., Tomescu, A.M.F. & Sanders, W.B. (eds.), Biology of lichens – symbiosis, ecology, environmental monitoring, systematics and cyber applications. – Biblioth. Lichenol. 105: 47–56. Wieczorek, J., Guo, Q. & HiJmans, R. J. 2004. The point-radius method for georeferencing locality descriptions and calculating associated uncertainty. Int. J. Geographical Information Science 18(8): 747–767 [download|http://www.snsb.info/SNSBwiki/attach/Attachments/Wieczorek%20%20et%20al.%202004.pdf] ! Papers on ["Mass digitization of natural history collections"|http://www.pensoft.net/journals/zookeys/issue/209/] ! Papers on a GBIF-supported ["Data publishing framework for primary biodiversity data"|http://www.biomedcentral.com/bmcbioinformatics/supplements/12/S15]